Главная российская премия в области рок-музыки выросла из одноименного хит-парада «Нашего радио». Изначально каждый год под таким названием проходил музыкальный фестиваль, на который приглашались группы, занимавшие высокие позиции в хит-параде, а в 2008 году было решено учредить музыкальную премию.

Первая церемония вручения наград за достижения в отечественной рок-музыке состоялось 7 марта 2008 году в СК «Олимпийский». Первые три года победители определялись в два этапа: сначала жюри, состоявшее из известных критиков и заметных деятелей шоу-бизнеса, определяло список номинантов, из которого потом слушатели «Нашего радио» выбирали лучших. В 2011 году порядок определения победителей изменился, и теперь в список номинантов автоматически попадают группы и песни, участвовавшие в хит-параде.

Так как в хит-параде «Чартова дюжина» 13 позиций, премия вручается в 13 номинациях: «Группа», «Альбом», «Песня», «Музыка», «Поэзия», «Солист», «Солистка», «Концерт», «Дебют», «Видеоклип», «Книга о рок-н-ролле», «Выбор Интернета», «Легенда».

«Выбор Интернета» — номинация, в которой побеждают исполнители, чье имя чаще всего вбивали посетители сайта «Нашего радио» в строке поиска. «Легендами» же  были признаны Егор Летов (посмертно), а также группы «Агата Кристи» и «Машина времени».

В течение трех лет главным призом премии была тяжелая книга из стекла и металла. По задумке «Нашего радио» у деятелей рок-музыки была возможность собрать полное «собрание сочинений» из тринадцати томов, но в 2011 году приз изменился. Теперь он представляет собой именную виниловую пластинку, на которую записаны все песни, побеждавшие в хит-параде в течение года, и лучшие композиции дебютантов.

В 2012 году церемония полностью поменяла свой формат: музыкальный марафон из «Олимпийского» перенесся  в концертный зал «Крокус Сити», а участники исполняли не только свои лучшие песни, а выступали в неожиданных дуэтах.
Полный список победителей «Чартовой дюжины-2012» выглядит так: в номинациях «Группа», «Поэзия», «Клип» — «Ляпис Трубецкой»; «Музыка», «Солистка» — Земфира**; «Солист» — Валерий Кипелов, «Альбом» — «Мода» группы «Браво»; «Концерт» — презентация альбома «Иначе» ДДТ; «Лидер «Чартовой дюжины» — «Смысловые галлюцинации» с песней «Погружаюсь»; «Выбор Интернета» — Noize MC**; «Взлом» — «Pianoбой»; «Песня» — «Бойцовский клуб» группы Louna и «Легенда» — группа «Воскресение».

В октябре 2012 года оргкоммитет «Чартовой дюжины» объявил о том, что премия переходит в клубный формат и пройдет 24 февраля в клубе Stadium Live.